Développement d’interfaces en ligne pour le support à la recherche en Santé avec R-Shiny

Lucas Longour, Géomaticien, IRD, UMR ESPACE-DEV

GdR ESoR - 20 octobre 2022


  • Licence professionnelle Cartographie, topographie et systèmes d’information géographique parcours Systèmes d’information géographique à La Rochelle en 2020
  • IRD (UMR ESPACE-DEV) depuis Septembre 2020
  • Au Cambodge depuis Octobre 2021

LeptoYangon

https://leptoyangon.geohealthresearch.org/


Sat4Health (SCO ClimHealth)

https://sat4health.geohealthresearch.org/


Wat-Health

https://wat-health.geohealthresearch.org/


COVID ECOMORE

https://covid.geohealthresearch.org/


Serveur de tuiles

https://tiles.geohealthresearch.org/

  • Des tuiles organisées en répertoires (X/Y/ZOOM) qui peuvent être générées avec QGIS
  • Simple a mettre en place car il ne nécessite par de brique logicielle supplémentaire
  • Format TMS/XYZ lisible par QGIS, par Leaflet

Autres outils de développement

  • Le package R Fusen pour construire un package R à partir d’un notebook en Rmarkdown
  • Le package R Golem pour construire des applications Shiny de production (modularisation, possibilité de dockeriser ses applications)
  • Quarto, un système de publication scientifique et technique open-source basé sur Pandoc avec de nombreux formats disponibles (utilisé pour cette présentation)